Ing. Dagmar Stehlíková, Ph.D.

• Detekce houbových patogenů u kmínu a mrkve (možno i řešerše)
• Diagnostika infekčních onemocnění u laboratorních zvířat (možno i rešerše)

Ing. Eva Jozová, Ph.D.

• Analýza izoemzymových markerů u dihaploidních linií zelenin
• Detekce pohlaví kura domácího v raných embryonálních stádiích (zadáno)

Ing. Libor Večerek, Ph.D.

• Současný a předpokládaný význam molekulárně genetické technologie CRISPR-Cas9 pro biologii (užitkovost, zdraví) hospodářských zvířat, případně domácích zvířat
• Využití biomodelů hospodářských zvířat, při řešení vybraných zdravotních problémů v medicíně
• Podobnost vybraných monogenních defektů na fyziologii a zdraví u prasat a člověka

Ing. Mgr. Ondřej Hejna

• Způsoby barvení dormantních spór nádorovitosti

prof. Ing. Jindřich Čítek, CSc.

• Genetická diverzita skotu (prasat, koní, kura, psů, koček atd.) – literární rešerše.
• Dědičné poruchy zdraví skotu (prasat, koní, kura, psů atd.) – literární rešerše. Dle zájmu posluchače je možné zaměřit na choroby monogenní, polygenní, chromozomální aberace.
• Metodické problémy genetické diverzity hospodářských zvířat - literární rešerše.
• Užitkové vlastnosti prasat – podle zájmu a možností posluchače literární rešerše nebo zpracování vlastních dat.
• Analýza užitkových vlastností skotu (dojený skot, masný skot) ve vybraném zemědělském podniku.

Ing. Dagmar Stehlíková, Ph.D.

• Rychlá detekce Mycoplasma pulmonis u laboratorních hlodavců metodou LAMP (zadáno)
• Rychlá molekulární diagnostika bakterie Streptococcus uberis v mléce (zadáno)
• Optimalizace metody real-time PCR pro detekci bakterií rodu Helicobacter (zadáno)
• Optimization of a Loop-mediated isothermal amplification (LAMP)–based field detection method for fungal pathogens in vegetables (event. v českém jazyce) (for MFA)

Ing. Pavel Beran, Ph.D.

• Návrh a implementace grafického uživatelského rozhraní pro řízení a monitorování bioinformatického nástroje KEC při návrhu sekvenčně specifických diagnostických markerů z genomických dat
• Vývoj a validace metody loop-mediated isothermal amplification pro rychlou a citlivou detekci Pneumocystis canis
• Detekce a genotypizace Pneumocystis spp. v plicní tkáni hlodavců pomocí molekulárních markerů
• Detekce a genotypizace Pneumocystis spp. v plicní tkáni hlodavců pomocí molekulárních markerů (for MFA)

Ing. Eva Jozová, Ph.D.

• Analýza izoemzymových markerů u dihaploidních linií zelenin
• Detekce pohlaví kura domácího v raných embryonálních stádiích (zadáno)
• Hodnocení odrůdové čistoty máku setého pomocí molekulárních markerů
• Hodnocení odrůdové čistoty řepky olejné pomocí molekulárních markerů

Ing. Libor Večerek, Ph.D.

• Analýza mléčné užitkovosti skotu ve vybraném zemědělském podniku, ve vztahu k úrovni plemenářské práce ve sledovaném období

Ing. Mgr. Ondřej Hejna

• Rozpoznávání jednotlivých fází životního cyklu nádorovitosti pod mikroskopem
• Stanovení rychlosti napadení hostitele nádorovitostí
• Návrh a validace detekčních PCR primerů pro jednotlivé patotypy nádorovitosti
• Návrh a validace detekčních PCR primerů k rezistentním oblastem v genomu hostitele k nádorovitosti

prof. Ing Vladislav Čurn, CSc.

• Statistická analýza morfologických, cytogenetických a molekulárních dat v populacích Gymnadenia conopsea agg.
• Využití metody adaptivní laboratorní evoluce pro selekci kmene E. coli s vysokou produkcí rekombinantních nukleosidových fosforyláz
• Error-prone PCR jako nástroj pro vytvoření knihovny mutantních nukleosidových fosforyláz E. coli
• Analýza přítomnosti mikroplastů v úlech z polyuretanových úlových konstrukčních materiálů

prof. Ing. Jindřich Čítek, CSc.

• Vliv polymorfismu vybraných kódujících lokusů na mléčnou a/nebo masnou užitkovost skotu.
• Analýza užitkových vlastností skotu (dojený skot, masný skot) ve vybraném zemědělském podniku.
• Chovatelská a ekonomická analýza úrovně chovu dojeného/masného skotu ve vybraném zemědělském podniku

Témata řešených disertačních prací se vztahují k problematice aplikace biotechnologických a molekulárních metod a postupů v genetice a šlechtění olejnin, zelenin či zvířat; k problematice studia genetiky abiotického a biotického stresu u rostlin a využití moderních metod analýzy genomu a transkriptomu pro identifikaci kandidátních genů zapojených do reakce rostlin na stres; vývoji molekulárních metod pro včasnou detekci patogenů a na využití moderních vícerozměrných statistických metod při zpracovávání dat z biotechnologických experimentů.

Informace pro zájemce o doktorské studium jsou uvedeny na webových stránkách fakulty:

• https://www.fzt.jcu.cz/cz/studium/doktorske-studium
• https://www.fzt.jcu.cz/cz/fakulta/dokumenty/opatreni-a-rozhodnuti-dekana#studium