Katedra genetiky
a biotechnologií
Pro studenty
Studijní plány
- Bakalářský studijní program Zemědělské biotechnologie,
- Navazující magisterský studijní program Zemědělské biotechnologie
Bakalářské a Diplomové práce
Návrhy témat bakalářských a diplomových prací vypisovaných v AR 2023/24
prof. Jindřich Čítek, CSc.
- Genetická diverzita skotu (prasat, koní, kura, psů, koček atd.) – literární rešerše.
- Dědičné poruchy zdraví skotu (prasat, koní, kura, psů atd.) – literární rešerše. Dle zájmu posluchače je možné zaměřit na choroby monogenní, polygenní, chromozomální aberace.
- Metodické problémy genetické diverzity hospodářských zvířat – literární rešerše.
- Užitkové vlastnosti prasat – podle zájmu a možností posluchače literární rešerše nebo zpracování vlastních dat.
- Vliv polymorfismu vybraných kódujících lokusů na mléčnou a/nebo masnou užitkovost skotu.
- Genetická analýza vybraných dědičných poruch zdraví skotu.
- Analýza užitkových vlastností skotu (dojený skot, masný skot) ve vybraném zemědělském podniku.
- Chovatelská a ekonomická analýza úrovně chovu dojeného/masného skotu ve vybraném zemědělském podniku.
Ing. Pavel Beran, Ph.D.
- Genetická diverzita xanthomonád spojených s bakteriální skvrnitostí rajčete na základě metaanalýzy genomických dat
- Metaanalýza genomu Ralstonia solanacearum
- Metaanalýza genomu Erwinia amylovora
- Metodika pro návrh oligonukleotidů na základě nekompletních genomických sekvencí
- Návrh metodiky pro porovnávání nekompletních genomických sekvencí baterií
Ing. Dagmar Stehlíková, Ph.D.
- Optimalizace loop mediated isothermal amplification markeru pro detekci fytopatogenních hub
- Vývoj nástrojů pro včasnou molekulární diagnostiku patogenů
- Screeaning genu SOD1, který způsobuje degenerativní myelopatii (DM) metodou real-time PCR u ovčáckých plemen
- Molekulární detekce anaplazmózy (Anaplasma phagocytophilum) u ovčáckých plemen
- Diagnostika infekčních onemocnění u laboratorních zvířat metodou real-time PCR
Ing. Libor Večeřek, Ph.D.
- Význam nové molekulárně genetické technologie CRISPR-Cas9 pro biologii hospodářských zvířat (užitkovost, zdraví), případně využívání zvířat, jako biomodelů – literární rešerše
- Genetické příčiny kongenitálních defektů u prasat – literární rešerše
- Současný a předpokládaný význam molekulárně genetické technologie CRISPR-Cas9 pro biologii (užitkovost, zdraví) hospodářských zvířat, případně domácích zvířat.
- Využití biomodelů hospodářských zvířat, při řešení vybraných zdravotních problémů v medicíně.
- Podobnost vybraných monogenních defektů na fyziologii a zdraví u prasat a člověka
prof. Ing. Vladislav Čurn, Ph.D.
- Analýza morfologických znaků v populacích Gymnadenia conopsea agg.
- Výskyt klíšťat nakažených borrelií ve venkovských a meziměstských oblastech (Incidence of ticks infected with Borrelia in rural and semi-urban areas)
Ing. Eva Jozová, Ph.D.
- Hodnocení genetické variability pomocí molekulárních markerů u brukvovitých zelenin
- Hodnocení genetické variability pomocí molekulárních markerů u hořčice
- Genotypizace genetických zdrojů slepic
Ing. Pavel Beran, Ph.D.
- Genetická diverzita xanthomonád spojených s bakteriální skvrnitostí rajčete na základě metaanalýzy genomických dat
- Metaanalýza genomu Ralstonia Solanacearum
- Metaanalýza genomu Erwinia amylovora
- Metodika pro návrh oligonukleotidů na základě nekompletních genomických sekvencí
- Návrh metodiky pro porovnávání nekompletních genomických sekvencí baterií
Ing. Dagmar Stehlíková, Ph.D.
- Diagnostika infekčních onemocnění u laboratorních zvířat metodou real-time PCR
- Optimalizace loop mediated isothermal amplification pro identifikaci hmyzu určeného pro lidskou potřebu v potravinách
- Safeguarding urban trees and forests – system for early detection of invasive fungal pathogens
- Detection of infectious pathogens in laboratory animals
Ing. Libor Večeřek, Ph.D.
- Analýza mléčné užitkovosti skotu ve vybraném zemědělském podniku
- Analýza mléčné užitkovosti skotu ve vybraném zemědělském podniku, ve vztahu k úrovni plemenářské práce ve sledovaném období
prof. Jindřich Čítek, CSc.
- Vliv polymorfismu vybraných kódujících lokusů na mléčnou a/nebo masnou užitkovost skotu.
- Genetická analýza vybraných dědičných poruch zdraví skotu.
- Analýza užitkových vlastností skotu (dojený skot, masný skot) ve vybraném zemědělském podniku.
- Chovatelská a ekonomická analýza úrovně chovu dojeného/masného skotu ve vybraném zemědělském podniku.
Ing. Mgr. Ondřej Hejna, Ph.D.
- Identifikace genů rezistence vůči patogenům brukvovitých rostlin (Identification of resistance genes main pathogens of Brassica crops)
- Studium virulence patotypů Plasmodiophora brassicae a identifikace genů rezistence (Study of virulence of Plasmodiophora brassicae pathotypes and identification of resistance genes to clubroot)
- Molekulární metody pro rychlou a spolehlivou identifikaci rostlinných patogenů (Molecular tools for fast and reliable identification of plant pathogens)
- Studium genové exprese a akumulace stresových proteinů v podmínkách abiotického stresu (Study of gene expression and accumulation of stress proteins under conditions of abiotic stress)
- Vývoj molekulárních metod pro zlepšení tolerance plodin vůči suchu (Development of molecular tools for improvement of drought tolerance in crops
Témata řešených disertačních prací se vztahují k problematice aplikace biotechnologických a molekulárních metod a postupů v genetice a šlechtění olejnin, zelenin či zvířat; k problematice studia genetiky abiotického a biotického stresu u rostlin a využití moderních metod analýzy genomu a transkriptomu pro identifikaci kandidátních genů zapojených do reakce rostlin na stres; vývoji molekulárních metod pro včasnou detekci patogenů a na využití moderních vícerozměrných statistických metod při zpracovávání dat z biotechnologických experimentů.
Informace pro zájemce o doktorské studium jsou uvedeny na webových stránkách fakulty:
Praxe
Katedra zajišťuje praxe studentů bakalářského a magisterského studijního programu Zemědělské biotechnologie. Praxe probíhají v laboratořích katedry, na pracovištích Biologického centra AV ČR, na šlechtitelských pracovištích, ve specializovaných laboratořích.
Garantem praxí na katedře je Ing. Libor Večerek, Ph.D. (tel. 389 03 2723,