Oddělení vědy a výzkumu Fakulty zemědělské a technologické JU koordinuje výzkumnou činnost fakulty, zprostředkovává aktuální výzvy k podávání projektových žádostí, novinky v oblasti výzkumných aktivit, výzvy k nominacím na ocenění apod. Zároveň poskytuje administrativní podporu při přípravě žádostí, jejich schvalování na úrovni fakulty i v rámci celé Jihočeské univerzity. Dále zajišťuje formální kontrolu, zprostředkování právní kontroly a podpisy smluv na úrovni Jihočeské univerzity. Všechny aktuálně řešené i ukončené jsou uvedeny v části Granty a projekty.

Oddělení VaV se rovněž administrativně podílí na habilitačních a profesorských řízení. Ta probíhají za spolupráce Oddělení VaV a Vědecké rady. Na návrh uchazeče zajišťuje Oddělení VaV administrativní úkony, které jsou nezbytné pro podporu úspěšného řízení ke jmenování kandidáta.