Systém ultrarychlé kapalinové chromatografie umožňuje velmi rychlý proces chromatografické separace při zachování vynikající úrovně rozlišení. Hmotnostní detektor typu lineární iontové pasti LTQ XL má vysokou citlivost a díky režimu MSn umožňuje studie struktur neznámých přírodních látek. Detektor má možnost ionizace elektrosprejem (ESI) i ionizace chemické (APCI)

Použití: kvantitativní analýza přírodních látek ze skupiny organosirných sloučenin, biogenních aminů a polyaminů, flavonoidů a fenolických kyselin a dalších biologicky aktivních látek. Strukturní analýza unikátních přírodních látek

Systém Agilent 1260 Infinity II je všestranný vysoce výkonný preparativní kapalinový chromatograf umožňující průtoky mobilní fáze až 25 ml/min. Součástí systému je také automatický dávkovač i sběrač frakcí s maximální kapacitou jímacích baněk 1800 ml/analýzu

Použití: šetrná izolace rozmanitých sloučenin z celé řady materiálů (potravin, zemědělských produktů, léčivých rostlin apod.)

Chromatografický systém umožňuje velmi rychlou a efektivní analýzu při nízké spotřebě rozpouštědel a zachování vysoké rozlišovací schopnosti a reprodukovatelnosti

Použití: analýza širokého spektra organických analytů, zejména biogenních aminů a rostlinných fenolických látek

MS je vybavený iontovou pastí a zařízením pro elektronovou i chemickou ionizaci. Spojení účinné separační metody (kapilární GC) s vysoce citlivou a specifickou detekcí (MS) umožňuje určení struktury a identifikaci stopových množství organických látek ve vzorku

Použití: Identifikace mastných kyselin v lipidech, analýza senzoricky aktivních látek potravin

Stopová elementární analýza těžkých kovů

Použití: stanovení mikroelementů v nejrůznějších matricích, především v povrchových vodách a dnových sedimentech

Jednoúčelový analyzátor určený k ultrastopovému stanovování rtuti ve všech typech matric

Použití: stanovení rtuti ve vzorcích významných pro životní prostředí

Použití: vysoceúčinný rozklad především anorganických materiálů v autoklávech účinkem mikrovlnného záření

Katedra má několik systémů pro přípravu demineralizované vody. Tento systém poskytuje vodu o měrném odporu 18,3 MΩ.cm, vyhovující pro účely ultrastopové analýzy.

Šetrné sušení nejrůznějších vzorků při velmi nízké teplotě a tlaku, vhodný zejména pro biologický materiál (zemědělské plodiny, maso, mléko, léčivky).