V 50. letech 20. století začala výrazně stoupat poptávka po odbornících v oblasti zemědělství. Vysoké školy v Praze a Brně však přijímaly jen malé množství studentů z jižních a západních Čech, přičemž mnozí z nich se po absolvování studia do svého domovského regionu již nevraceli. Z tohoto důvodu bylo rozhodnuto o založení nové zemědělsky orientované fakulty, která by tak lépe odpovídala potřebám těchto regionů.
Vládním nařízením č. 120/1960 Sb. ze dne 5. 8. 1960 o změnách v organizaci vysokých škol, v paragrafu 6, byla k 1. září 1960 zřízena Provozně ekonomická fakulta v Českých Budějovicích jako čtvrtá fakulta Vysoké školyzemědělské v Praze.
Děkan
prof. Ing. Jaroslav Neumann, CSc.
(1960–1970)
V prvních letech fungování fakulty se hlavní pozornost soustředila na vytvoření kvalitního pedagogického sboru. Část vyučujících přišla z fakult pražské Vysoké školy zemědělské a z Pedagogické fakulty Univerzity Karlovy, další ze středních škol, z institucí řídících zemědělství nebo přímo ze zemědělské praxe. Již ve druhém akademickém roce byla zahájena výuka v oboru zootechnika, následovaná o rok pozdějiotevřením oboru fytotechnika.
Druhá polovina sedmdesátých let byla dynamickým obdobím rozvoje celé fakulty. Výtrazně vzrostla odborná kvalifikace učitelů i technických pracovníků.
Fakulta si postupně budovala renomé uznávaného výzkumného pracoviště zaměřeného na specifické podmínky zemědělské výroby v horských a podhorských oblastech.
Postgraduální studium se stává pravidelnou součástí výuky a po několik dalších let rozšiřuje a prohlubuje znalosti absolventů v oblasti vědeckého řízení a racionalizace rostlinné i živočišné výroby. Zároveň se soustavně rozvíjí studentská a vědecká odborná činnost.
Děkan
prof. Ing. Antonín Klesnil, CSc.
(1970–1973)
Děkan
prof. Ing. Vladimír Krupauer, CSc.
(1973–1989)
Do konce roku 1975 byly realizovány první dvě etapy výstavby. V jejich rámci byla vybudována společná ubytovací a stravovací zařízení se zdravotním střediskem, inženýrsko-technická síť a několik provozních objektů, včetně pavilon zemědělské techniky a zooveterinárních disciplín, dílen a garáží.
Změny v zaměření fakulty vedly ke změně jejího názvu. Nařízením vlády č. 69/1985 Sb., o některých změnách v organizaci vysokých škol, paragrafu 2, byla k 1. září 1985 zrušena Provozně ekonomická fakulta a vznikla Agronomická fakulta v Českých Budějovicích.
Po Sametové revoluci v roce 1989 začala fakulta napravovat křivdy z období totalitního režimu. Následovalo období hlubokých změn, které zahrnovaly jak rehabilitace nespravedlivě postižených zaměstnanců, tak rozsáhlou personální obměnu a reformu vnitřní organizace.
Dochází k urychlení habilitačních a profesorských řízení, která byla dříve často blokována z ideologických důvodů. Začínají se přizpůsobovat studijní plány novým podmínkám, zejména s ohledem na přechod k tržní ekonomice. Zároveň umožnila studentům ekonomicky zaměřených oborů prodloužit studium o pátý ročník.
Děkan
prof. Ing. Jaroslav Kursa, DrSc.
(1990–1991)
Znovu se otevřela myšlenka vytvoření samostatné vysoké školy v Českých Budějovicích, která byla dříve odmítnuta. Fakulta se aktivně zapojovala do příprav vzniku Jihočeské univerzity. Probíhaly diskuse o její podobě, struktuře a legislativních krocích.
Dne 28. září 1991 byla Agronomická fakulta začleněna do nově vzniklé Jihočeské univerzity v Českých Budějovicích a současně změnila svůj název na Zemědělskou fakultu.
Jihočeská univerzita byla při svém vzniku tvořena Zemědělskou a Pedagogickou fakultou. V listopadu 1991 se rozšířila o další fakulty: Biologickou, Teologickou a Zdravotně sociální.
Vznikem Jihočeské univerzity se Zemědělská fakulta definitivně osamostatnila od Vysoké školy zemědělské v Praze, pod kterou spadala od roku 1960.
Děkan
prof. Ing. Josef Zvára, CSc.
(1991–1994)
Rektor
doc. RNDr. Jiří Divíšek, CSc.
(1991–1998)
Reforma studijních programů přinesla nové obory s důrazem na podnikání a ekonomiku v zemědělství.
Fakulta zároveň posílila vědeckou a výzkumnou činnost ve spolupráci s Akademií věd ČR a zapojila se do mezinárodních projektů.
Studenti získali nové možnosti zahraničních praxí, zejména v západní Evropě.
Začleněním do Jihočeské univerzity fakulta získala stabilnější finanční zázemí, které umožnilo modernizaci vybavení a výrazný rozvoj výzkumné činnosti. Současně došlo ke zvýšení prestiže fakulty díky užší spolupráci s průmyslem a zemědělskou praxí, což vedlo k lepšímu propojení teoretického vzdělávání s reálnými potřebami trhu a zlepšilo uplatnění absolventů v praxi.
Po změnách v 90. letech se studijní programy postupně ustálily. Fakulta upevnila strukturu bakalářských, magisterských a doktorských oborů a zaměřila se na jejich modernizaci, aby lépe odpovídaly požadavkům trhu práce a aktuálním trendům v zemědělství.
Děkan
prof. Ing. František Střeleček, CSc.
(1994–1998)
Do mobilitních programů (např. Erasmus) se zapojovalo stále více studentů, kteří tak získali možnost absolvovat zahraniční stáže.
Došlo ke vzniku nových kateder zaměřených na pozemkové úpravy, podnikání v zemědělství a kvalitu potravin, čímž se rozšířila nabídka studijních programů.
Děkan
prof. Ing. Jan Frelich, CSc.
(1998–2004)
Do roku 2000 na fakultě studovalo téměř 2 000 studentů a postupně se rozvíjely doktorské studijní programy.
Fakulta postupně zaváděla kreditní systém studia podle evropských standardů (ECTS), což umožnilo lepší mobilitu studentů a individualizaci studia.
Obory byly modularizovány, tj. rozděleny do tematických bloků, které si studenti mohli volit.
Děkanka
prof. Ing. Magdaléna Hrabánková, CSc., dr. h. c., prof. h. c.
(2004–2006)
Fakulta se začala více zaměřovat na ekologické hospodaření, kvalitu potravin a moderní biotechnologické metody, čímž posílila svou specializaci v oblasti udržitelného zemědělství.
V roce 2009 se od Zemědělské fakulty oddělila katedra rybářství, a došlo tak ke vzniku Fakulty rybářství a ochrany vod.
Děkan
prof. Ing. Miloslav Šoch, CSc., dr. h. c.
(2008–2020)
Byla naplánována demolice staré budovy zemědělské techniky a výstavba nové, modernější stavby, která měla zlepšit zázemí pro výuku i výzkum. Realizace projektu byla stanovena na období 2011–2013.
Ve spolupráci s národním podnikem Budějovický Budvar byl v roce 2016 na Zemědělské fakultě založen Výzkumný a výukový minipivovar. Jeho hlavním cílem je praktická výuka studentů v oblasti pivovarnictví a potravinářských technologií. Studentům umožňuje získat zkušenosti s celým procesem vaření piva – od surovin přes výrobu až po finální produkt. Minipivovar zároveň slouží k výzkumným účelům, kde se testují nové technologické postupy, kvalita surovin a inovace v pivovarnictví. Od svého založení se piva vařená v minipivovaru získala uznání i mimo akademickou půdu – pravidelně se umisťují na předních místech v tuzemských i mezinárodních degustačních soutěžích.
prof. Ing. Martin Křížek, CSc.
pověřen řízením
(2007)
Ing. Karel Suchý, Ph.D.
pověřen řízením
(2012)
V oblasti infrastruktury fakulta investovala do modernizace laboratorního vybavení a experimentálních zařízení, tím byla umožněna realizace pokročilých výzkumných projektů. Studenti byli aktivně zapojeni do vědeckých aktivit a měli možnost prezentovat své práce na mezinárodních konferencích, čímž se podpořil jejich profesní rozvoj a vědecká excelence.
Od roku 2021 se fakulta výrazně posunula směrem k technologickému rozvoji, mezinárodní spolupráci a propojení s praxí. Změnou názvu na Fakultu zemědělskou a technologickou v roce 2022 tak reaguje na aktuální vývoj v zemědělství i v celé společnosti.
Děkan
doc. RNDr. Petr Bartoš, dr. h. c.
(2020–2028)
Fakulta se aktivně zapojuje také do evropských projektů, jako jsou H2020 NEXTFOOD nebo ERASMUS+ trAEce a SoFarTEAM, jejichž cílem je inovovat vzdělávací přístupy a posílit propojení studentů s praxí již během studia.
Dochází k navazování mezinárodních vztahů i mimo Evropský kontinent.
V oblasti infrastruktury byla zahájena výstavba prostor pro výuku fermentačních procesů (rekonstrukce sýpky), došlo k modernizaci laboratoří a podpory výuky praktických dovedností.
Započala příprava výstavby aplikačního pavilonu Smart Agritech, který posílí propojení s praxí a vytvoří prostor pro intenzivnější spolupráci s partnery z aplikační sféry.
Děkan
prof. Ing. Jaroslav Neumann, CSc.
(1960–1970)
Děkan
prof. Ing. Antonín Klesnil, CSc.
(1970–1973)
Děkan
prof. Ing. Vladimír Krupauer, CSc.
(1973–1989)
Děkan
prof. Ing. Jaroslav Kursa, DrSc.
(1990–1991)
Děkan
prof. Ing. Josef Zvára, CSc.
(1991–1994)
Děkan
prof. Ing. František Střeleček, CSc.
(1994–1998)
Děkan
prof. Ing. Jan Frelich, CSc.
(1998–2004)
Děkanka
prof. Ing. Magdaléna Hrabánková, CSc., dr. h. c., prof. h. c.
(2004–2006)
Děkan
prof. Ing. Miloslav Šoch, CSc., dr. h. c.
(2008–2020)
Děkan
doc. RNDr. Petr Bartoš, dr. h. c.
(2020–2028)